возможно, имелись ввиду корабли республиканской постройки

Таких приказов было аж 150:
https://starwars.fandom.com/ru/wiki/Чрезвычайные_приказы_Великой_армии_Республики:_Исполнение_приказов,_Приказы_с_1_по_150

Это все было продумано задолго до диснея и его сценаристов, которые все только испортили.

Палыч тут не при чем, чипы клонам вживляли каминоанцы, которые растили клонов в тайне ото всех.

Почитай книги из старого канона - узнаешь много нового. Книги писались взрослыми людьми для взрослых людей, так что там и Империя не такая плохая, и повстанцы не такие хорошие.
А дисней, как раз ориентируется на исключительно детскую аудиторию, для которой нужно максимально упростить лор, превратив космическую Игру Престолов в Феечек Винкс.

рядовые клоны выращивались более послушными, спецназ и офицеры были более самостоятельными, но, в любом случае, они должны были быть умнее и самостоятельнее дроидов (иначе не было бы смысла их создавать). В старом лоре большинство клонов выполнило приказ 66 особо не задумываясь, т.к. приказ гласил, что джедаи предатели и пытались совершить переворот (были и другие номерные приказы, в т.ч. и на арест/ликвидацию сенаторов, самого Палыча и даже экстерминатус какой-нибудь планеты). Некоторые клоны приказ выполняли аж с радостью, т.к. им в командование достались джедаи, которые их считали за "мясных дроидов", особо не считаясь с потерями (на первых этапах войны в армии клонов даже своих полевых медиков не было, т.к. считали, что проще нового вырастить, чем лечить). А были случаи, когда наоборот, клоны отказывались выполнять приказ 66, т.к. уважали своих джедаев командиров и не а=верили в их измену.
А потом все это перечеркнули и придумали, что во всем виноваты оболванивающие чипы.

Разве чипы придумали до Мыши? Они же появились в 6м сезоне мультсериала, который уже при диснее снимали.

Думаю, зависит от планеты. В Вахе, например, "самый гуманный легион" Императора - Саламандры, вырезали под ноль все население одной планетки (Caldera), где люди вполне мирно жили вместе с эльдарами (не, ну а че они?..), а вот миры, заселенные только людьми, могут и не тронуть. Тут еще вопрос об отношении к самим ксеносам ЗВ - по канону, некоторые из них, произошли от людей (ТвиЛек, например), и, ЕМНИП, даже могут иметь с людьми общее потомство, что наводит на мысль о признании их апхуманами, по примеру огринов, ратлингов и фелинидов.

да не - нормально все. Видно, что они на одной ступеньке, просто Вейдер намного выше его ростом.

Канон, который мы потеряли...